比較糖蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定

為了克服這個(gè)域存在的技術(shù)限制，在項(xiàng)新的研究中，奧地利科學(xué)院分子生物技術(shù)研究所（IMBA）主任Josef Penninger博士及其團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)出質(zhì)譜法和算法，終能夠?qū)?fù)雜的糖結(jié)構(gòu)進(jìn)行綜合識(shí)別，并且將它們繪制到相應(yīng)糖蛋白的正確位點(diǎn)上。他們新開(kāi)發(fā)的比較糖蛋白質(zhì)組學(xué)（comparative glycoproteomics）平臺(tái)于2017年9月20月在線發(fā)表在Nature期刊上，論文標(biāo)題為“Comparative glycoproteomics of stem cells identifies new players in ricin toxicity”。論文第作者為IMBA研究員Jasmin Taubenschmid博士和IMBA蛋白質(zhì)組研究員Johannes Stadlmann。他們的方法被稱作為SugarQb（Sugar Quantitative Biology），能夠獲得對(duì)生物系統(tǒng)中的蛋白糖基化和聚糖修飾的全局性認(rèn)識(shí)。他們將這種平臺(tái)應(yīng)用于兩項(xiàng)概念驗(yàn)證研究---對(duì)胚胎干細(xì)胞糖蛋白質(zhì)組進(jìn)行分析和鑒定出毒性產(chǎn)生所必需的糖蛋白---中。

利用這種新的SugarQb方法，這些研究人員次繪制出小鼠和人胚胎干細(xì)胞糖蛋白質(zhì)組草圖。他們的研究結(jié)果幾乎將所有已知的糖蛋白的數(shù)量增加了倍。他們也揭示出多種新的糖基化蛋白，這些糖基化蛋白包括進(jìn)化上保守的糖修飾，以及小鼠和人干細(xì)胞多能性因子中的物種特異性糖修飾。他們發(fā)現(xiàn)的很多這樣的糖基化蛋白位于細(xì)胞膜上，而且參與細(xì)胞間信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞相互作用和胚胎發(fā)育。

SugarQb方法可以免費(fèi)給所有的科學(xué)們。Stadlmann說(shuō)，“我們希望我們的平臺(tái)將讓各地的研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)識(shí)別糖結(jié)構(gòu)和它們?cè)谙鄳?yīng)蛋白上的位置來(lái)開(kāi)拓這個(gè)未知的域?！?Penninger補(bǔ)充道，“糖基化在包括*癥在內(nèi)中發(fā)揮著重要的作用。SugarQb方法將讓科學(xué)們揭示新的生物學(xué)機(jī)制。它可能也被臨床醫(yī)師用來(lái)確定異常的糖蛋白質(zhì)組特征為生物標(biāo)志物和追蹤作出的反應(yīng)。

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